Kirgizië is een land van ongerepte natuur, bergen, meren, rivieren en een uitgebreide prachtige en uitzonderlijke fauna en flora. Om dergelijke schatten te behouden is het nodig om bepaalde gebieden te beschermen.

Eind jaren '40 werd het eerste initiatief genomen door de oprichting van ‘zapovedniki’ of een staatsreservaat in de regio van Issyk-kul. Later kwamen ook in Sary-Chelek, Besh-Aral, Naryn, Karatal-Japyryk en Sarychat-Ertash dergelijke reservaten. Deze werden opgericht met het oog op het behoud van de natuur, maar ook voor wetenschappelijk onderzoek. In principe zijn deze parken slechts gedeeltelijk toegankelijk voor publiek.

Vele van deze zapovedniki liggen rond belangrijke meren. Zoals het reservaat van Issyk-Kül, maar ook het reservaat van Sary Chelek.

Karatal-Japyryk is een reservaat dat opgedeeld is in drie delen: de meren van Chatyr Kül en Song-Kül en het bos in de buurt van Song-Kül.

Iets verder van Issyk-Kül, ten zuiden van Karakol in de Tian Shan bergen ligt Sarychat Ertash.

Besh Aral ligt vrij afgelegen en moeilijk te bereiken in de Chatkal vallei, helemaal in het Westen van de provincie Jalal-Abad, op de grens met Uzbekistan. Het is in 1979 opgericht om de uitzonderlijke fauna en flora te beschermen die enkel in de Westerse Tian Shan te vinden zijn. Er leven nog steeds sneeuwluipaarden, Tian Shan beren en Turkse lynxen.

Het reservaat van Naryn ligt ten oosten van de stad Naryn en is opgericht voor het behoud van bos en graslanden.

Naast de zapovedniki bestaan er nog nationale parken en natuurparken. Ook zij hebben tot doelstelling het behoud van de natuur, maar zijn toegankelijker voor publiek en worden vaak als recreatiegebied gebruikt. De bescherming van fauna en flora is er dan ook iets minder goed georganiseerd. Iedereen die in Bishkek is geweest, heeft ongetwijfeld al gehoord van het Ala-Archa nationaal park. Kirgiezen die aan het drukke leven in de hoofdstad willen ontsnappen trekken er maar al te graag enkele dagen op uit om te wandelen en te kamperen in het park. Hoewel er in het weekend dus wel wat beweging is, kan je er nog steeds bedreigde diersoorten als het Marco Polo schaap, beren, marmotten enz tegen het lijf lopen.

In de buurt van Bishkek bevindt zich Chong-Kemin nationaal park. Iets minder bekend, doch niet minder mooi.

Langs de oostkust van Issyk-kul heb je het Karakol natuurpark. In de buurt van Osh zijn er het Kyrgyz Ata en Kara-Shoro natuurpark.

Hiernaast bestaan er ook nog tientallen reservaten of zakazniki waar slechts een beperkt aantal economische activiteiten zijn toegelaten.

Hoewel al deze gebieden in theorie beschermd zijn, komt dit niet altijd overeen met de realiteit. Er is weinig controle op jacht en overbegrazing. Bovendien ontbreken de middelen voor een degelijk management van de parken.